Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74BQ96LY2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74BQ96LY2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms