Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR3Q96KR7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR3Q96KR7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms