Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms