Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNS1Q96KK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNS1Q96KK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms