Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms