Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZC2HC1AQ96GY0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms