Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP6Q96FZ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP6Q96FZ7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms