Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms