Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC5Q96DU9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms