Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4CQ96DT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms