Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA4Q96DD7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA4Q96DD7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms