Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TIFAQ96CG3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIFAQ96CG3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms