Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP13Q92995 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP13Q92995 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP13Q92995 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP13Q92995 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms