Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX1Q92499 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX1Q92499 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms