Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNAAF4Q8WXU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms