Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATAD2BQ8WXI9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms