Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRIPQ8WXE1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRIPQ8WXE1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms