Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF31Q8WWY3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms