Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF2

UCMA, Unique cartilage matrix-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCMAQ8WVF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UCMAQ8WVF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UCMAQ8WVF2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms