Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms