Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms