Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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