Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms