Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF397Q8NF99 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF397Q8NF99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms