Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA4Q8NEY3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms