Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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