Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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ZNF248Q8NDW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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ZNF248Q8NDW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF248Q8NDW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF248Q8NDW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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