Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG8Q8ND04 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMG8Q8ND04 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms