Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms