Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA6

C15orf53, Uncharacterized protein C15orf53, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf53Q8NAA6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C15orf53Q8NAA6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms