Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNBD1Q8NA66 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNBD1Q8NA66 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms