Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC4Q8N9L1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC4Q8N9L1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms