Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF148Q8N7C7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF148Q8N7C7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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