Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf62Q8N4C0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms