Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PROM2Q8N271 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PROM2Q8N271 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PROM2Q8N271 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PROM2Q8N271 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PROM2Q8N271 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PROM2Q8N271 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms