Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GPC2Q8N158 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC2Q8N158 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms