Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTROBQ8N137 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTROBQ8N137 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms