Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00518Q8N0U6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms