Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT1Q8IXI2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT1Q8IXI2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms