Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR49Q8IV35 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR49Q8IV35 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms