Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSIG1Q86XK7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSIG1Q86XK7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSIG1Q86XK7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSIG1Q86XK7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG1Q86XK7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms