Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF3Q86WH2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms