Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC84Q86UT8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms