Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PBRM1Q86U86 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PBRM1Q86U86 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PBRM1Q86U86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms