Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPM2Q86SE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
NPM2Q86SE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms