Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLNKQ7Z7G1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms