Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PKD1L3Q7Z443 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD1L3Q7Z443 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD1L3Q7Z443 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD1L3Q7Z443 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD1L3Q7Z443 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms