Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC11Q7Z392 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms