Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms