Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q7L0L9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q7L0L9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q7L0L9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q7L0L9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q7L0L9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q7L0L9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Q7L0L9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q7L0L9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q7L0L9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q7L0L9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms